MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011988	GCTC	2	8	58910	58917	0 %	25 %	25 %	50 %	222106182
1002	NC_011988	CAGT	2	8	58941	58948	25 %	25 %	25 %	25 %	222106182
1003	NC_011988	GGGGC	2	10	58968	58977	0 %	0 %	80 %	20 %	222106182
1004	NC_011988	GAA	2	6	58987	58992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106182
1005	NC_011988	A	6	6	59005	59010	100 %	0 %	0 %	0 %	222106182
1006	NC_011988	GCT	2	6	59028	59033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106182
1007	NC_011988	TGC	2	6	59207	59212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106182
1008	NC_011988	CAA	2	6	59233	59238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106182
1009	NC_011988	T	6	6	59299	59304	0 %	100 %	0 %	0 %	222106182
1010	NC_011988	TGC	3	9	59342	59350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106182
1011	NC_011988	GGC	2	6	59416	59421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106182
1012	NC_011988	GGC	2	6	59448	59453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106182
1013	NC_011988	TGG	2	6	59471	59476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106182
1014	NC_011988	CGG	2	6	59548	59553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106182
1015	NC_011988	GAT	2	6	59643	59648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106182
1016	NC_011988	GC	3	6	59668	59673	0 %	0 %	50 %	50 %	222106182
1017	NC_011988	CTC	2	6	59687	59692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106182
1018	NC_011988	GCG	2	6	59694	59699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106182
1019	NC_011988	GCC	2	6	59713	59718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106182
1020	NC_011988	GCC	2	6	59723	59728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106182
1021	NC_011988	CGT	3	9	59947	59955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106183
1022	NC_011988	CAT	2	6	59992	59997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106183
1023	NC_011988	GTGG	2	8	60062	60069	0 %	25 %	75 %	0 %	222106183
1024	NC_011988	GAT	2	6	60079	60084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106183
1025	NC_011988	GCC	2	6	60089	60094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106183
1026	NC_011988	CCG	2	6	60096	60101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106183
1027	NC_011988	CCG	2	6	60105	60110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106183
1028	NC_011988	TGA	2	6	60114	60119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106183
1029	NC_011988	CTG	2	6	60152	60157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106183
1030	NC_011988	GCC	2	6	60158	60163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106183
1031	NC_011988	CAT	2	6	60178	60183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106183
1032	NC_011988	TTG	2	6	60189	60194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106183
1033	NC_011988	CTG	2	6	60200	60205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106183
1034	NC_011988	GCC	2	6	60213	60218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106183
1035	NC_011988	TGG	2	6	60333	60338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106183
1036	NC_011988	CGG	2	6	60339	60344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106183
1037	NC_011988	AT	3	6	60356	60361	50 %	50 %	0 %	0 %	222106183
1038	NC_011988	GCC	2	6	60557	60562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106183
1039	NC_011988	GTT	2	6	60569	60574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106183
1040	NC_011988	TGA	2	6	60591	60596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106183
1041	NC_011988	CAA	2	6	60634	60639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106183
1042	NC_011988	T	6	6	60686	60691	0 %	100 %	0 %	0 %	222106183
1043	NC_011988	GAT	2	6	60712	60717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106183
1044	NC_011988	GAT	2	6	60727	60732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106183
1045	NC_011988	G	6	6	60746	60751	0 %	0 %	100 %	0 %	222106183
1046	NC_011988	CTG	2	6	60788	60793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106183
1047	NC_011988	GATCAT	2	12	60853	60864	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222106183
1048	NC_011988	TGA	2	6	60936	60941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106183
1049	NC_011988	CGT	2	6	60958	60963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106183
1050	NC_011988	TGT	2	6	61005	61010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106183
1051	NC_011988	TCT	2	6	61110	61115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106183
1052	NC_011988	TCA	2	6	61173	61178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106183
1053	NC_011988	AG	3	6	61253	61258	50 %	0 %	50 %	0 %	222106183
1054	NC_011988	AT	3	6	61411	61416	50 %	50 %	0 %	0 %	222106184
1055	NC_011988	GCCG	2	8	61450	61457	0 %	0 %	50 %	50 %	222106184
1056	NC_011988	TGC	2	6	61685	61690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106184
1057	NC_011988	GGA	2	6	61725	61730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106184
1058	NC_011988	TGATCG	2	12	61742	61753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222106184
1059	NC_011988	GTG	2	6	61760	61765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106184
1060	NC_011988	GGT	2	6	61812	61817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106184
1061	NC_011988	GAT	2	6	61833	61838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106184
1062	NC_011988	ATG	2	6	61889	61894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106184
1063	NC_011988	GCG	2	6	61895	61900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106184
1064	NC_011988	TA	3	6	61924	61929	50 %	50 %	0 %	0 %	222106184
1065	NC_011988	CT	3	6	61954	61959	0 %	50 %	0 %	50 %	222106184
1066	NC_011988	TTG	2	6	62009	62014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106184
1067	NC_011988	CGGATG	2	12	62033	62044	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222106184
1068	NC_011988	TTG	2	6	62063	62068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106184
1069	NC_011988	GC	3	6	62157	62162	0 %	0 %	50 %	50 %	222106184
1070	NC_011988	GCA	2	6	62377	62382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106185
1071	NC_011988	ATTTC	2	10	62433	62442	20 %	60 %	0 %	20 %	222106185
1072	NC_011988	CTG	2	6	62603	62608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106185
1073	NC_011988	CCT	2	6	62671	62676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106185
1074	NC_011988	GGC	2	6	62684	62689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106185
1075	NC_011988	CAG	2	6	62739	62744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106185
1076	NC_011988	TGTC	2	8	62781	62788	0 %	50 %	25 %	25 %	222106185
1077	NC_011988	CGC	2	6	62878	62883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106185
1078	NC_011988	GGGC	2	8	62913	62920	0 %	0 %	75 %	25 %	222106185
1079	NC_011988	TTG	2	6	62984	62989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106185
1080	NC_011988	CGAC	2	8	62992	62999	25 %	0 %	25 %	50 %	222106185
1081	NC_011988	CTC	2	6	63002	63007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106185
1082	NC_011988	CTT	3	9	63052	63060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106185
1083	NC_011988	GCC	2	6	63069	63074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106185
1084	NC_011988	CGT	2	6	63151	63156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106185
1085	NC_011988	TCC	2	6	63299	63304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106185
1086	NC_011988	TGAT	2	8	63438	63445	25 %	50 %	25 %	0 %	222106185
1087	NC_011988	ATC	2	6	63866	63871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106186
1088	NC_011988	AGA	2	6	63926	63931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106186
1089	NC_011988	AGC	2	6	63977	63982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106186
1090	NC_011988	ATG	2	6	64007	64012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106186
1091	NC_011988	GGC	2	6	64018	64023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106186
1092	NC_011988	TTC	2	6	64030	64035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106186
1093	NC_011988	CGG	2	6	64154	64159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106186
1094	NC_011988	CCA	2	6	64191	64196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106186
1095	NC_011988	TCC	2	6	64226	64231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106186
1096	NC_011988	GCAA	2	8	64280	64287	50 %	0 %	25 %	25 %	222106186
1097	NC_011988	GGC	2	6	64329	64334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106186
1098	NC_011988	CCCAA	2	10	64377	64386	40 %	0 %	0 %	60 %	222106186
1099	NC_011988	GGC	2	6	64441	64446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106186
1100	NC_011988	GTC	2	6	64543	64548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106186
1101	NC_011988	GAT	2	6	64552	64557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106186
1102	NC_011988	CGG	2	6	64575	64580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106186
1103	NC_011988	GTTCTC	2	12	64648	64659	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222106186
1104	NC_011988	GAAA	2	8	64780	64787	75 %	0 %	25 %	0 %	222106186
1105	NC_011988	GTC	2	6	64829	64834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106186
1106	NC_011988	GAA	2	6	64908	64913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106186
1107	NC_011988	GAA	2	6	64925	64930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106186
1108	NC_011988	GCT	2	6	64942	64947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106186
1109	NC_011988	GTTC	2	8	64983	64990	0 %	50 %	25 %	25 %	222106186
1110	NC_011988	CCG	2	6	64991	64996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106186
1111	NC_011988	CCG	2	6	65052	65057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106186
1112	NC_011988	GAG	2	6	65075	65080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106186
1113	NC_011988	CG	3	6	65272	65277	0 %	0 %	50 %	50 %	222106186
1114	NC_011988	CCT	2	6	65289	65294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106186
1115	NC_011988	GAT	2	6	65444	65449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106186
1116	NC_011988	GAT	2	6	65455	65460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106186
1117	NC_011988	GATAGA	2	12	65903	65914	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222106187
1118	NC_011988	GAA	2	6	65967	65972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106187
1119	NC_011988	CGA	2	6	66032	66037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106187
1120	NC_011988	GGC	2	6	66123	66128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106187
1121	NC_011988	ATG	2	6	66151	66156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106187
1122	NC_011988	GAC	2	6	66279	66284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106187
1123	NC_011988	AGC	2	6	66289	66294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106187
1124	NC_011988	AAT	2	6	66397	66402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106187
1125	NC_011988	GTC	2	6	66433	66438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106187
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1240	NC_011988	GCCT	2	8	75128	75135	0 %	25 %	25 %	50 %	222106194
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1246	NC_011988	CTCGG	2	10	75534	75543	0 %	20 %	40 %	40 %	222106195
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1249	NC_011988	TGC	2	6	75694	75699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106195
1250	NC_011988	GAAT	2	8	75735	75742	50 %	25 %	25 %	0 %	222106195
1251	NC_011988	GCG	2	6	75764	75769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106195
1252	NC_011988	CAA	2	6	75808	75813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106195
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1254	NC_011988	GTG	2	6	75848	75853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106195
1255	NC_011988	TCA	2	6	75900	75905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106195
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1259	NC_011988	TC	3	6	76189	76194	0 %	50 %	0 %	50 %	222106195
1260	NC_011988	CAT	3	9	76222	76230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106195
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1264	NC_011988	CG	3	6	76996	77001	0 %	0 %	50 %	50 %	222106196
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1366	NC_011988	ATC	2	6	83318	83323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106202
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1370	NC_011988	TGG	2	6	83601	83606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106202
1371	NC_011988	ACA	2	6	83679	83684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106202
1372	NC_011988	GCCA	2	8	83714	83721	25 %	0 %	25 %	50 %	222106202
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1374	NC_011988	GAT	2	6	83794	83799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106202
1375	NC_011988	CAT	2	6	83902	83907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106202
1376	NC_011988	GAAGAC	2	12	83909	83920	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222106202
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1378	NC_011988	CCT	2	6	83985	83990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106202
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1387	NC_011988	ATG	2	6	84714	84719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106203
1388	NC_011988	ATC	2	6	84795	84800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106203
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1490	NC_011988	TCT	2	6	90752	90757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106208
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1498	NC_011988	CCCT	2	8	91572	91579	0 %	25 %	0 %	75 %	222106209
1499	NC_011988	GCT	2	6	91596	91601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106209
1500	NC_011988	GCC	2	6	91654	91659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106209

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